Q&A με τον βιοχημικό Alexis Komor – Biomedical Beat Blog – Εθνικό Ινστιτούτο Γενικών Ιατρικών Επιστημών

Q&A με τον βιοχημικό Alexis Komor – Biomedical Beat Blog – Εθνικό Ινστιτούτο Γενικών Ιατρικών Επιστημών

August 3, 2022 0 Von admin
Ένα headshot του Δρ. Komor.
Δρ Αλέξης Κομόρ. Πίστωση: Michelle Fredricks.

DNA είναι απίστευτα όμορφο μόριο, και είναι τόσο σημαντικό. Ο καθένας μας κύτταρα έχει μόνο ένα αντίγραφο DNA, και αν καταστραφεί, αυτό ανατρέπει οτιδήποτε άλλο στο κύτταρο», λέει. Alexis Komor, Ph.D.επίκουρος καθηγητής χημείας και βιοχημεία στο Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια στο Σαν Ντιέγκο (UCSD). Δείτε τα σημαντικότερα σημεία της συνέντευξής μας με τη Δρ. Komor για να μάθετε για το επιστημονικό της ταξίδι, την έρευνα για το DNA και τις συμβουλές για τους μαθητές.

ΕΡ.: Πώς αποφάσισες να σπουδάσεις χημεία;

ΕΝΑ: Μου άρεσαν πολύ τα μαθηματικά και οι θετικές επιστήμες στο γυμνάσιο και στο γυμνάσιο. Όταν έκανα αίτηση στο κολέγιο, ήξερα ότι ήθελα να ασχοληθώ με τις επιστήμες αντί των μαθηματικών, επειδή ένιωθα ότι ήταν πιο σχετικό με αυτό που βιώνουμε σε καθημερινή βάση. Τελικά μπήκα μέσα χημεία για έναν ανόητο λόγο, αλλά κοιτάζοντας πίσω τώρα, είμαι τόσο πολύ ευγνώμων που το έκανα. Η χημεία έχει αυτή την ωραία ισορροπία επειδή σας επιτρέπει όχι μόνο να κατανοήσετε πώς λειτουργούν τα πράγματα σε ένα μοριακός επίπεδο αλλά και να δείτε πώς αυτές οι μοριακές λειτουργίες σχετίζονται με τα καθημερινά φαινόμενα—για παράδειγμα, κατανοώντας πώς η βλάβη του DNA σε μοριακό επίπεδο μπορεί να οδηγήσει σε αρνητικά αποτελέσματα για την υγεία.

Ε: Ποια ήταν η πορεία σας για να γίνετε επιστήμονας;

ΕΝΑ: Όταν ξεκίνησα το κολέγιο στο Πανεπιστήμιο της Καλιφόρνια στο Μπέρκλεϋ, ο μεγαλύτερος αδερφός μου, ο οποίος επίσης ασχολείται με τις επιστήμες, μου είπε ότι ήταν σημαντικό να αποκτήσω μια προπτυχιακή ερευνητική θέση. κατέληξα στο εργαστήριο του Δρ Κρις Τσανγκ δουλεύοντας με έναν απόφοιτο σε ένα ανόργανος έργο χημείας. Ήμουν απίστευτα ευγνώμων για την ευκαιρία και όλες τις δεξιότητες που έμαθα, αλλά τελικά συνειδητοποίησα ότι ήθελα να δουλέψω σε πιο σχετικά βιολογικά ερευνητικά έργα.

Όταν έκανα αίτηση για Ph.D. προγράμματα, δίσταζα να ξεκινήσω την έρευνα για κάτι εντελώς νέο, αλλά ήξερα ότι ήθελα να ασχοληθώ περισσότερο με το χημική βιολογία χωράφι και να δουλέψεις για γυναίκα. Ήμουν ευγνώμων που βρήκα Δρ Τζάκι Μπάρτον κάνοντας έρευνα στον τομέα της βιοοργανικής χημείας στο Ινστιτούτο Τεχνολογίας της Καλιφόρνια. Για το διδακτορικό μου, εργάστηκα σε το εργαστήριό της δημιουργώντας μικρές ενώσεις με βάση το μέταλλο που θα δεσμεύονταν σε σημεία βλάβης του DNA.

ΕΡ.: Ποια ήταν τα επόμενα βήματά σας;

ΕΝΑ: Όταν ήμουν έτοιμος να αποφοιτήσω, άρχισα να ψάχνω για μεταδιδακτορική θέση. Ήθελα να εστιάσω περισσότερο στη βιολογία, αλλά να διατηρήσω μια χημική προοπτική σε αυτήν. Ήμουν νευρικός για τη διακλάδωση επειδή οι περισσότεροι άνθρωποι θέλουν να προσλάβουν μεταδιδακτορικούς που θα χτυπήσουν το έδαφος τρέχοντας. Έκανα αίτηση για συνεργασία Δρ Ντέιβιντ Λιου επειδή είχε εκπαιδευτεί ως χημικός και στη συνέχεια είχε διακλαδωθεί σε πρωτεΐνη μηχανικός, οπότε σκέφτηκα ότι ίσως θα έβλεπε λίγο τον εαυτό του σε μένα. Μου έκανε μια πρόταση και πήγα το εργαστήριό του στο Broad Institute του MIT και του Χάρβαρντ.

Ο Δρ Κόμορ στέκεται ανάμεσα σε δύο άλλους ερευνητές, όλοι φορώντας εργαστηριακά παλτά και γάντια.  Κρατάει ένα ανοιχτό τετράδιο εργαστηρίου και δείχνει ένα πιάτο Petri που κρατάει ψηλά ο ερευνητής στα αριστερά της.
Ο Δρ Komor (κέντρο) στη δουλειά στο εργαστήριο. Πίστωση: Weixin Tang.

Είχα καταλήξει σε αυτή την τρελή ιδέα που ονομάζεται βασική επεξεργασία. Περιλάμβανε τη λήψη μιας βάσης DNA και την πραγματοποίηση μιας πολύ μικρής χημικής αντίδρασης σε αυτήν για να την αλλάξει σε μια διαφορετική βάση με πιο αποτελεσματικό και ακριβή τρόπο από άλλους γονιδίωμα-Μέθοδοι επεξεργασίας. Αλλά στην αρχή του μεταδιδακτορικού μου, δεν ήξερα πώς να κάνω τις εργαστηριακές τεχνικές που χρειαζόμουν για το έργο μου. Ευτυχώς, έκανα φίλους με ανθρώπους που τους γνώριζαν και με εκπαίδευσαν. Όταν τελικά έφτιαξα το έργο σε λειτουργία και το δημοσιεύσαμε, ο Δρ Λιου είπε, «Αυτό είναι ένα μεγάλο χαρτί. Όλα τα βλέμματα είναι στραμμένα πάνω σας και θα πρέπει να υποβάλετε αίτηση για θέσεις καθηγητών». Έτσι, το έκανα και κατέληξα να έχω τη θέση που έχω τώρα στο UCSD.

Ε: Σε τι εστιάζει το εργαστήριό σας;

ΕΝΑ: Το εργαστήριό μου θέλει να καταλάβει καλύτερα πώς παραλλαγές στο DNA μας επηρεάζουν την υγεία μας. Η αλληλουχία DNA κάθε ατόμου είναι διαφορετική. Πολλές από αυτές τις παραλλαγές απλώς συμβάλλουν σε διαφορετικά χαρακτηριστικά, αλλά υπάρχουν και εκείνα που έχουν αρνητικές επιπτώσεις στην υγεία. Οι ερευνητές έχουν ανακαλύψει εκατοντάδες εκατομμύρια τρόπους με τους οποίους το γονιδίωμά μας μπορεί να διαφέρει, αλλά γνωρίζουμε τις επιπτώσεις στην υγεία λιγότερο από 1 τοις εκατό από αυτούς. Το εργαστήριό μου παίρνει παραλλαγές ενδιαφέροντος και τις μελετά σε κυτταρικά μοντέλα. Προηγούμενες εργασίες σε αυτόν τον τομέα είχαν επικεντρωθεί σε παραλλαγές που σχετίζονται με ανθρώπους ευρωπαϊκής καταγωγής, αλλά το εργαστήριό μου στοχεύει να μελετήσει αυτούς από ανθρώπους κάθε καταγωγής.

Ε: Πώς σας έχει υποστηρίξει το NIGMS;

Μια ομάδα 14 ατόμων που ποζάρουν για μια φωτογραφία σε εξωτερικούς χώρους.
Η Δρ Komor (κάτω αριστερά) με μέλη του εργαστηρίου της. Πίστωση: Τζέφρι Τσεν.

ΕΝΑ: Ξεκίνησε όταν ήμουν μεταδιδακτορικός και πήρα ένα Υποτροφία F32. Αυτή ήταν η πρώτη φορά που έπρεπε να γράψω μια πραγματική πρόταση επιχορήγησης και με έκανε να κάνω μερικά βήματα πίσω και να σκεφτώ πραγματικά σε τι ήθελα να επικεντρωθώ μακροπρόθεσμα. Στη συνέχεια, όταν ξεκίνησα το εργαστήριό μου, πήρα ένα Επιχορήγηση ανάπτυξης τεχνολογίας R21 για την ανάπτυξη περισσότερων εργαλείων στον τομέα της επεξεργασίας γονιδιώματος. Πραγματικά ενίσχυσε την αυτοεκτίμησή μου, και οι μαθητές ήταν επίσης πολύ ενθουσιασμένοι, επειδή πήραμε την πρώτη μας μεγάλη επιχορήγηση. Μετά από αυτό, έκανα αίτηση στο Πρόγραμμα Maximizing Investigators‘ Research Award (MIRA).. Μόλις έλαβα το MIRA, πήρα και συμπληρώματα για να υποστηρίξω δύο από τους μαθητές μου. Το ένα ήταν ένα συμπλήρωμα διαφορετικότητας για έναν φοιτητή από οικονομικά μειονεκτικό υπόβαθρο και το άλλο ήταν για την καλοκαιρινή ερευνητική εμπειρία ενός προπτυχιακού φοιτητή. Το εργαστήριό μου δεν θα ήταν αυτό που είναι τώρα χωρίς την επιχορήγηση MIRA!

ΕΡ.: Ποιους στόχους ελπίζετε να πετύχετε με την καριέρα σας;

ΕΝΑ: Θέλω να κάνω ενδιαφέρουσες συνεισφορές στον τομέα και να βοηθήσω τους ανθρώπους να κατανοήσουν καλύτερα τη γενετική ποικιλότητα. Γίνομαι πολύ γενικός γιατί τα πράγματα αλλάζουν πάντα—πρέπει να δούμε τι ανακαλύπτουμε και μετά να ακολουθήσουμε αυτά τα αποτελέσματα. Ίσως μας οδηγήσουν σε μια νέα κατεύθυνση.

Θέλω επίσης να βεβαιωθώ ότι οι εκπαιδευόμενοι μου έχουν επιτυχημένη καριέρα. Παίρνω το mentoring μου πολύ, πολύ σοβαρά. Θέλω όλοι όσοι έρχονται στο εργαστήριό μου να έχουν εξαιρετική εκπαίδευση, να γίνουν ανεξάρτητοι επιστήμονες και να κάνουν καταπληκτικά πράγματα.

Ε: Τι συμβουλή θα δίνατε σε φοιτητές που ενδιαφέρονται να ακολουθήσουν μια καριέρα στην επιστήμη;

ΕΝΑ: Καν ‚το! Και μην ανησυχείτε αν υπάρχουν κάποια μαθήματα επιστήμης που δεν σας αρέσουν. Υπάρχουν τόσα πολλά διαφορετικά πεδία στην επιστήμη—απλώς πρέπει να καταλάβετε τι είναι πιο ενδιαφέρον για εσάς. ενθουσιάζομαι νουκλεϊκό οξύ τη χημεία και την ανάπτυξη νέων τρόπων χειρισμού του DNA. Δοκιμάστε διαφορετικά πράγματα μέχρι να καταλάβετε τι σας ενθουσιάζει πραγματικά.

Η έρευνα του Δρ. Komor υποστηρίζεται από την επιχορήγηση NIGMS R35GM138317.